RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 NTSP30990 170 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CLDN8P56748 225 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 C21orf58P58505 322 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC29A4Q7RTT9 530 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF227Q86WZ6 799 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR7A2PQ8NGA2 310 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 WWTR1Q9GZV5 400 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 LRFN1Q9P244 771 aa25.1■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1B0GUH1 482 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CDK2AP1O14519 115 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PDPK1O15530 556 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CD46P15529 392 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PRPS1L1P21108 318 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DCTP40126 519 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FRKP42685 505 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 HLCSP50747 726 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 EPGNQ6UW88 154 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF441Q8N8Z8 693 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 C16orf52Q8NHV5 167 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ACTRT2Q8TDY3 377 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 RELTQ969Z4 430 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR52B2Q96RD2 323 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 RASL10BQ96S79 203 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRA2Q9H9E1 313 aa25.09■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DYNC1I1O14576 645 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SP1P08047 785 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMP1P11279 417 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 RPL3P39023 403 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SSR4P51571 173 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PER3P56645 1201 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 PIGGQ5H8A4 983 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR7G2Q8NG99 324 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OR52R1Q8NGF1 315 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 COQ8BQ96D53 544 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ERP27Q96DN0 273 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 GAL3ST4Q96RP7 486 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 AIG1Q9NVV5 245 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 BCAP29Q9UHQ4 241 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 DTX4Q9Y2E6 619 aa25.08■■□□□ 1.61
GNPTAB-202ENST00000392919 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD28O15084 1053 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PLOD3O60568 738 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 NADKO95544 446 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC25A25Q6KCM7 469 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ADIPOR1Q96A54 375 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 FRMD6Q96NE9 622 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO7BQ6PIF6 2116 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ASPDHA6ND91 283 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PLOD2O00469 737 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 DIAPH2O60879 1101 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TGDSO95455 350 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX5P17844 614 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CYB561P49447 251 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 EMDP50402 254 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CPTPQ5TA50 214 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 NXNQ6DKJ4 435 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM107Q6UX40 140 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM156Q8N614 296 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM178AQ8NBL3 297 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A087WV62 115 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 EDF1O60869 148 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC25A12O75746 678 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SLITRK5O94991 958 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 OR6B1O95007 311 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 GPX3P22352 226 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SOX3P41225 446 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MC3RP41968 323 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM198Q66K66 360 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CAMKMTQ7Z624 323 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP70Q8NHQ1 597 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ELP4Q96EB1 424 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 DPY30Q9C005 99 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CFL2Q9Y281 166 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 NOTCH2Q04721 2471 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNHIT1O43257 154 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 NME6O75414 186 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 IDH3AP50213 366 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 MANFP55145 182 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 HSPB3Q12988 150 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 LYPD8Q6UX82 237 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFP28Q8NHY6 868 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ASB15Q8WXK1 588 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms