RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ELP4Q96EB1 424 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS4AQ9UN37 437 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRB8 838 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC36A6NLP5 189 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DIAPH2O60879 1101 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 P04436 131 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO45P0C2W1 286 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMP1P11279 417 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IDO1P14902 403 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MC3RP41968 323 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EMDP50402 254 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXK1P85037 733 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PGS1Q32NB8 556 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF385BQ569K4 471 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM107Q6UX40 140 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2L13Q8N349 312 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GRHL3Q8TE85 626 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FAR1Q8WVX9 515 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB18Q99592 522 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ITPAQ9BY32 194 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OLAHQ9NV23 265 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 AIG1Q9NVV5 245 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FRG2CA6NGY1 282 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 UPK1AO00322 258 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX18P35713 384 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT20P35900 424 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR5P85299 388 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTA3Q16772 222 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FHL5Q5TD97 284 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 EPGNQ6UW88 154 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM13CQ8NE31 585 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MIB2Q96AX9 1013 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGED4Q96JG8 741 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD9Q96Q07 612 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP26Q9BV47 211 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CNIH4Q9P003 139 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TO15178 435 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 UBDO15205 165 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CFLARO15519 480 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 EMC8O43402 210 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PEX1O43933 1283 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CNR1P21554 472 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCD3P28288 659 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR3DL1P43629 444 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP8Q13202 625 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NTRK2Q16620 822 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 GK5Q6ZS86 529 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MDGA2Q7Z553 956 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TESCQ96BS2 214 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 VSTM2LQ96N03 204 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms