RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 ADCK2Q7Z695 626 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 KRT73Q86Y46 540 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 UCN3Q969E3 161 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 QRFPRQ96P65 431 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf62Q9BQA9 187 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RHBGQ9H310 441 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ABCB9Q9NP78 766 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TRPC4Q9UBN4 977 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 IRAK3Q9Y616 596 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM77I1YAP6 450 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 FAAHO00519 579 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT2O60909 372 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA7AO75326 666 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TPPPO94811 219 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PCCBP05166 539 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RB1P06400 928 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ALAS2P22557 587 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 GPC1P35052 558 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RORCP51449 518 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 MXD1Q05195 221 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SYPL1Q16563 259 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf53Q5VUE5 145 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 XKRXQ6PP77 449 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TCEANCQ8N8B7 351 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM80Q96HE8 168 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OPALINQ96PE5 141 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 WFDC6Q9BQY6 131 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TAPBPLQ9BX59 468 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PELI2Q9HAT8 420 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 DSPPQ9NZW4 1301 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TMPRSS11DO60235 418 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 KCNJ5P48544 419 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 VEGFBP49765 207 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TIGD3Q6B0B8 471 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 HMGN2P46Q86SG4 172 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR5D16Q8NGK9 328 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PMEPA1Q969W9 287 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RGMAQ96B86 450 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 WDFY2Q96P53 400 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 HHATLQ9HCP6 504 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 B3GNT2Q9NY97 397 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 A8MUA0 341 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PDGFAP04085 211 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NR2F1P10589 423 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 GSTM5P46439 218 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PRKAG1P54619 331 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SPHARQ15513 63 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.426e-8■■■□□ 16.2
TMOD1-202ENST00000375175 PDZK1Q5T2W1 519 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OLIG3Q7RTU3 272 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NUDT13Q86X67 352 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CACUL1Q86Y37 369 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SFTPA1Q8IWL2 248 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 IQCF1Q8N6M8 205 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR8H1Q8NGG4 311 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR5K2Q8NHB8 316 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 DEC1Q9P2X7 70 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35F4A4IF30 521 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 M0R3H8 397 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NDUFS4O43181 175 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CSO75390 466 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 NME6O75414 186 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 STATHP02808 62 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RPN2P04844 631 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SCG5P05408 212 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF250P15622 560 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CPN2P22792 545 aa12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms