RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ATL3Q6DD88 541 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC23A3Q6PIS1 610 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DPY19L4Q7Z388 723 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMPRSS6Q8IU80 811 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR2L5Q8NG80 312 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 IRGQQ8WZA9 623 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PIGCQ92535 297 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO32Q969P5 355 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf66Q96MD2 445 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD9Q96Q07 612 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GPER1Q99527 375 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMED9Q9BVK6 235 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CHST11Q9NPF2 352 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 VPS54Q9P1Q0 977 aa2.33□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRCP08575 1304 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NUMA1Q14980 2115 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WWV3 80 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV25A0A0B4J276 109 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR6C75A6NL08 312 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 E7ENQ6 273 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 H0YJX3 145 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LEFTY2O00292 366 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NBR2O15453 112 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CIDEAO60543 219 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SDC3O75056 442 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NEURL1O76050 574 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LRATO95237 230 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TGM6O95932 706 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 IGHA1P01876 353 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KRT16P08779 473 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR2T7P0C7T2 308 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 VPREB1P12018 145 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PSMC3P17980 439 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SPINK2P20155 84 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NR4A1P22736 598 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 POU1F1P28069 291 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GYG1P46976 350 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC6A8P48029 635 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB10P48595 397 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCT3P49368 545 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RAB5CP51148 216 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CDR2Q01850 454 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HSF2Q03933 536 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SELPLGQ14242 412 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SQLEQ14534 574 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF234Q14588 700 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF385BQ569K4 471 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TTMPQ5BVD1 217 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TTC23Q5W5X9 447 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TTC23LQ6PF05 361 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DEGS2Q6QHC5 323 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF813Q6ZN06 617 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM228AQ86W67 206 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CRLF3Q8IUI8 442 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF34Q8IZ26 560 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR8K1Q8NGG5 319 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PAQR8Q8TEZ7 354 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM46BQ96A09 425 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC39Q96DD0 335 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 IGSF21Q96ID5 467 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LMLNQ96KR4 655 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LRR1Q96L50 414 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TOX2Q96NM4 488 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 APOL2Q9BQE5 337 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CAPS2Q9BXY5 557 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CHIAQ9BZP6 476 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TPK1Q9H3S4 243 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AZI2Q9H6S1 392 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM138Q9NPI0 162 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 USE1Q9NZ43 259 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms