RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361115.4

CCL28-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL28, Length 3,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-201ENST00000361115 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 MLIPQ5VWP3 458 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 XKRXQ6PP77 449 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 DENND1CQ8IV53 801 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SP110Q9HB58 689 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 ABCB9Q9NP78 766 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 MCUBQ9NWR8 336 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CD274Q9NZQ7 290 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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CCL28-201ENST00000361115 AUP1Q9Y679 476 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.3□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 PI4KAP42356 2102 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 A6NJY4 79 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 B4E171 279 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 LMO7DNF2Z398 122 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 FPGTO14772 594 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TNFRSF10CO14798 259 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 WDR47O94967 919 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 DDCP20711 480 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CPN2P22792 545 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 KELP23276 732 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CSKP41240 450 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 WASP42768 502 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL28-201ENST00000361115 CLCN7P51798 805 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CDH4P55283 916 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 PRSS12P56730 875 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 MXD1Q05195 221 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 EFEMP1Q12805 493 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 POU4F3Q15319 338 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CFAP161Q6P656 301 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 USP53Q70EK8 1073 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 OR8H3Q8N146 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 ENKURQ8TC29 256 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 WDFY2Q96P53 400 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TM9SF2Q99805 663 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 REEP1Q9H902 201 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SERHLQ9NQF3 203 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 OSER1Q9NX31 292 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 MPP6Q9NZW5 540 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CMAHPQ9Y471 501 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SLC35F4A4IF30 521 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL28-201ENST00000361115 F5H5T6 163 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 J3KR12 359 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 FFAR3O14843 346 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 GPR42O15529 346 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TSPAN12O95859 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 PEX11BO96011 259 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 GABRB1P18505 474 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 PTPN6P29350 595 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TALDO1P37837 337 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SOX3P41225 446 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 STC1P52823 247 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 C21orf58P58505 322 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCL28-201ENST00000361115 MESP2Q0VG99 397 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 MANEAQ5SRI9 462 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 AGBL4Q5VU57 503 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 TMEM215Q68D42 235 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CRELD1Q96HD1 420 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 APOLD1Q96LR9 279 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 OPALINQ96PE5 141 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 HHATLQ9HCP6 504 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.29□□□□□ -1.24
CCL28-201ENST00000361115 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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