RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358572.9

TMA16-201, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMA16, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-201ENST00000358572 FGF17O60258 216 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DCKP27707 260 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SHC2P98077 582 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 CHRNEQ04844 493 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SEC23BQ15437 767 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DEF8Q6ZN54 512 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ISOC1Q96CN7 298 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DOK1Q99704 481 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 CALML5Q9NZT1 146 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 RNF6Q9Y252 685 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 LMO7DNF2Z398 122 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 FAM227AF5H4B4 570 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SGK494L7N484 410 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 M0R3H8 397 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 PROS1P07225 676 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 PCMT1P22061 227 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SMIM11AP58511 58 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TUBA3CQ13748 450 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TAGAPQ8N103 731 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ZG16BQ96DA0 208 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 RASSF1Q9NS23 344 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.67□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 A0A087WV62 115 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 A0A1W2PRQ8 180 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SYT5O00445 386 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 FAAHO00519 579 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 AQP9O43315 295 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 LDB3O75112 727 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 AGR2O95994 175 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 IFI6P09912 130 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 POU2F1P14859 743 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 FOSL2P15408 326 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ID2Q02363 134 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ZP2Q05996 745 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 MGAT2Q10469 447 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DGCR6Q14129 220 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DCST1Q5T197 706 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 Q7L0L9 218 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TCTN2Q96GX1 697 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 MPP4Q96JB8 637 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 MAP3K3Q99759 626 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 LHPPQ9H008 270 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SCN3BQ9NY72 215 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 KNL1Q8NG31 2342 aa14.66□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 K7ESF4 209 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 PLOD3O60568 738 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 FCMRO60667 390 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 SLITRK5O94991 958 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ADAP00813 363 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ITIH1P19827 911 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 BCKDHBP21953 392 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 KRT20P35900 424 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 RAB38P57729 211 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 CSNK2BP67870 215 aa14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMA16-201ENST00000358572 NPTX1Q15818 432 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms