RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ENPP2Q13822 863 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP12Q6UXS9 341 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZS52 159 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8J1Q8NGP2 316 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51I1Q9H343 314 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MVB12BQ9H7P6 319 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0A6YYD5 115 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CTDSP2O14595 271 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT33BQ14525 404 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4C11Q6IEV9 310 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 IL17RDQ8NFM7 739 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGB4Q8WW32 186 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX101Q9BY14 249 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 GLIPR2Q9H4G4 154 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CSO75390 466 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CKMT1AP12532 417 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SPHARQ15513 63 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OCLNQ16625 522 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RNLSQ5VYX0 342 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SDE2Q6IQ49 451 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 AMDHD1Q96NU7 426 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DPH7Q9BTV6 452 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC32Q9BV29 185 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 AICDAQ9GZX7 198 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNK12Q9HB15 430 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC4Q9Y296 219 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PRQ8 180 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF91Q05481 1191 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC34A3Q8N130 599 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 XAGE5Q8WWM1 108 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35G5Q96KT7 338 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 FCRL4Q96PJ5 515 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RACGAP1Q9H0H5 632 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf14Q9HBI5 128 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SCN3AQ9NY46 2000 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT2B17O75795 530 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DRD2P14416 443 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM23P36406 574 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX3P41225 446 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PCYT1AP49585 367 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PODNL1Q6PEZ8 512 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CD300LDQ6UXZ3 194 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TDHQ8IZJ6 230 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC30A2Q9BRI3 323 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CD207Q9UJ71 328 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MU76 341 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R3H8 397 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC3AO75596 197 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NR2F1P10589 423 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFV2P19404 249 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ENPP7Q6UWV6 458 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NANOGP1Q8N7R0 232 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SMRP1Q8NCR6 262 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNS3Q9BQ31 491 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TSSK6Q9BXA6 273 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL3Q9UH77 587 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 LRIT2A6NDA9 550 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYBB2P43320 205 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 MND1Q9BWT6 205 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ASPNQ9BXN1 380 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNPO2LQ9H987 977 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN32Q9NX65 697 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 EPPINO95925 133 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 APOA1P02647 267 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 HBQ1P09105 142 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TNNI3P19429 210 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFSF8P32971 234 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS19P39019 145 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms