RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK15Q96Q40 435 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LDAHQ9H6V9 325 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CKAP5Q14008 2032 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 E7ESA3 106 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CASC3O15234 703 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TGFB1P01137 390 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NFKBIDQ8NI38 313 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 FNDC9Q8TBE3 224 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DNTTIP1Q9H147 329 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 BRF2Q9HAW0 419 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 WASH6PQ9NQA3 447 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GUL6 1792 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ITPK1Q13572 414 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 BAK1Q16611 211 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SEMA4CQ9C0C4 833 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 VEGFDO43915 354 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CGB2Q6NT52 195 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR7D4Q8NG98 312 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC39A13Q96H72 371 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RANBP9Q96S59 729 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NOX1Q9Y5S8 564 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC119BA6NIH7 251 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LILRB5O75023 590 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 LGALS2P05162 132 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GP1BBP13224 206 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TAS2R19P59542 299 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK5R2Q13319 367 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GRIN2CQ14957 1233 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC14A2Q15849 920 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 NLRP8Q86W28 1048 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 IQCF1Q8N6M8 205 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 THAP4Q8WY91 577 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TTPALQ9BTX7 342 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 VNN3Q9NY84 501 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SCN2AQ99250 2005 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TIGD3Q6B0B8 471 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 DGAT2Q96PD7 388 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 GNG13Q9P2W3 67 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 POLLQ9UGP5 575 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CD84Q9UIB8 345 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPM6Q9BX84 2022 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PQH9 124 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R2P9O14990 202 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MAFKO60675 156 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF212Q495C1 297 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ANGPTL6Q8NI99 470 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MED17Q9NVC6 651 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 G6PDP11413 515 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CKMT1AP12532 417 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ADRB3P13945 408 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MALLQ13021 153 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB30Q15771 203 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MUSKO15146 869 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ECI2O75521 394 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 PRSS3P35030 304 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MTNR1AP48039 350 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVFC1P60507 584 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTR1AP61163 376 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MSMO1Q15800 293 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-201ENST00000356331 KCT2Q8NC54 265 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms