RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 PITX2Q99697 317 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 PINK1Q9BXM7 581 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 ADNPQ9H2P0 1102 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 PDE7BQ9NP56 450 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 THADAQ6YHU6 1953 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF548-201ENST00000336128 A0A087WV62 115 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 HYKKA2RU49 373 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 DUXAA6NLW8 204 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 A8MVJ9 347 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 B4GAT1O43505 415 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA7AO75326 666 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SLITRK5O94991 958 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 EPPINO95925 133 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 AGR2O95994 175 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ALPPP05187 535 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 EPHA2P29317 976 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PDX1P52945 283 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SKP1P63208 163 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZXDAP98168 799 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NPRL3Q12980 569 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SHBQ15464 509 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 COLEC12Q5KU26 742 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF675Q8TD23 568 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SLC9A6Q92581 669 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ARRDC5A6NEK1 342 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 LGI1O95970 557 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 IFI6P09912 130 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CT62P0C5K7 136 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GIMD1P0DJR0 217 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 AGXTP21549 392 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CBLP22681 906 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CRHBPP24387 322 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 HPCAP84074 193 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MGAT2Q10469 447 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 DUSP5Q16690 384 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 INAVAQ3KP66 663 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF773Q6PK81 442 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 APOL4Q9BPW4 351 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ACAD8Q9UKU7 415 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PLOD3O60568 738 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35E2P0CK97 266 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MYF5P13349 255 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TDGF1P13385 188 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GABARAPL2P60520 117 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CDK5R2Q13319 367 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FAM53BQ14153 422 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FGD3Q5JSP0 725 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TCTE1Q5JU00 501 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 VRK2Q86Y07 508 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms