RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL35Q6PF15 583 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZNX1 250 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBC2A0A5B9 178 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 E9PQ18 207 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PCMT1P22061 227 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 GSTM5P46439 218 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PLA2G16P53816 162 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SQSTM1Q13501 440 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 REEP3Q6NUK4 255 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 AMER3Q8N944 861 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 FEVQ99581 238 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 DUSP21Q9H596 190 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 THSD1Q9NS62 852 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 SCN3BQ9NY72 215 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1W2PPW3 197 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 LRIT2A6NDA9 550 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM1AO60341 852 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF10O60809 474 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SPIBQ01892 262 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 BCL2A1Q16548 175 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FGD3Q5JSP0 725 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC5A8Q8N695 610 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TTLQ8NG68 377 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52J3Q8NH60 311 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 UCN3Q969E3 161 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MUL1Q969V5 352 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PITX2Q99697 317 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C5AR2Q9P296 337 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0G2JN53 185 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJB5O75953 348 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ITIH1P19827 911 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SEPHS1P49903 392 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPK10P53779 464 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CDH12P55289 794 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NPTX1Q15818 432 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZIC1Q15915 447 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MICAQ29983 383 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2FQ969M7 185 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ITPKCQ96DU7 683 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DPH7Q9BTV6 452 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 AICDAQ9GZX7 198 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL31Q9H511 634 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 WASF3Q9UPY6 502 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0A6YYD5 115 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ISM1B1AKI9 464 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ANXA8P13928 327 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DRD2P14416 443 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CCNA2P20248 432 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 GRK3P35626 688 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 BCL6P41182 706 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC35A2P78381 396 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPB3Q12988 150 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms