RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 LIPT1Q9Y234 373 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 THADAQ6YHU6 1953 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FCMRO60667 390 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CCNB2O95067 398 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 GIMD1P0DJR0 217 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA8P13928 327 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PDX1P52945 283 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RPP38P78345 283 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CDK5R2Q13319 367 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FAM214AQ32MH5 1076 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35F3Q8IY50 421 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FBLIM1Q8WUP2 373 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 GABARAPL3Q9BY60 117 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.3■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DUXAA6NLW8 204 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CT62P0C5K7 136 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 POU2F1P14859 743 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CTSKP43235 329 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA4P54764 986 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 BNC1Q01954 994 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP5Q16690 384 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 TAGAPQ8N103 731 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF285Q96NJ3 590 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PDE7BQ9NP56 450 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DSPPQ9NZW4 1301 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HYKKA2RU49 373 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ACP2P11117 423 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PAX7P23759 505 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 KCNAB1Q14722 419 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SHBQ15464 509 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFA9Q16795 377 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MLIPQ5VWP3 458 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 VRK2Q86Y07 508 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SETD9Q8NE22 299 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PEX11GQ96HA9 241 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 IER2Q9BTL4 223 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 RAB33BQ9H082 229 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA6Q9UF33 1036 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.29■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 E9PQ18 207 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 H3BSA7 217 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 LGI1O95970 557 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MGAT2Q10469 447 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SYT16Q17RD7 645 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 FGD3Q5JSP0 725 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2FQ969M7 185 aa21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC160A6NGH7 325 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 A8MVJ9 347 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CASC3O15234 703 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ALPPP05187 535 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ERV3-1Q14264 604 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 AMZ1Q400G9 498 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 PITX2Q99697 317 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 APOL4Q9BPW4 351 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 CALML5Q9NZT1 146 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 MKLN1Q9UL63 735 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 A4GNTQ9UNA3 340 aa21.27■■□□□ 1
VSTM4-201ENST00000298454 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.27■■□□□ 1
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