RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 TMEM211Q6ICI0 200 aa23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NOXRED1Q6NXP6 359 aa23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PSD4Q8NDX1 1056 aa23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 OR10A5Q9H207 317 aa23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 C1orf109Q9NX04 203 aa23.51■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 DNAJC13O75165 2243 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TMEM233B4DJY2 109 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 LSM1O15116 133 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ERLIN1O75477 346 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 FBXO45P0C2W1 286 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PRSS53Q2L4Q9 553 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 EMC4Q5J8M3 183 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 IL20RBQ6UXL0 311 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 IKBIPQ70UQ0 350 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 LILRB4Q8NHJ6 448 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ERP27Q96DN0 273 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RGS14O43566 566 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 CBX7O95931 251 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NT5EP21589 574 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 CHRNB4P30926 498 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ALDH9A1P49189 494 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ZNF628Q5EBL2 1059 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RTL4Q6ZR62 310 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 LRTM1Q9HBL6 345 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RNF6Q9Y252 685 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.49■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PINLYPA6NC86 204 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ZWINTO95229 277 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TACR1P25103 407 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 FAM180BQ6P0A1 224 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RPRMLQ8N4K4 120 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SLC22A8Q8TCC7 542 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PAQR8Q8TEZ7 354 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NTNG2Q96CW9 530 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 ERVK-11Q9UQG0 969 aa23.48■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TBX19O60806 448 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SEC22BO75396 215 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TOXO94900 526 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 CHEK2O96017 543 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 GPX3P22352 226 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SLC18A1P54219 525 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 LTB4RQ15722 352 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 OR2M7Q8NG81 312 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RND1Q92730 232 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TLCD1Q96CP7 247 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 EGLN2Q96KS0 407 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 CCT7Q99832 543 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 HAO1Q9UJM8 370 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 DTX4Q9Y2E6 619 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.47■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 A0A0G2JMM0 328 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 A0A1W2PPB8 328 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 A0A1W2PRS3 328 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 KIR3DP1A8MWS1 328 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 PIP5K1BO14986 540 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 SERPINE1P05121 402 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 LINC00032P0C843 101 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 MSX1P28360 303 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 EMDP50402 254 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 C2orf80Q0P641 193 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NTRK2Q16620 822 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 DEFB127Q9H1M4 99 aa23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RP9-201ENST00000297157 NKX2-6A6NCS4 301 aa23.45■■□□□ 1.34
RP9-201ENST00000297157 TMEM114B3SHH9 223 aa23.45■■□□□ 1.34
RP9-201ENST00000297157 ITM2AO43736 263 aa23.45■■□□□ 1.34
RP9-201ENST00000297157 PLOD3O60568 738 aa23.45■■□□□ 1.34
RP9-201ENST00000297157 PDE9AO76083 593 aa23.45■■□□□ 1.34
RP9-201ENST00000297157 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RP9-201ENST00000297157 IFI6P09912 130 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms