RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF639Q9UID6 485 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 SCML1Q9UN30 329 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PARP14Q460N5 1801 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RP1P56715 2156 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 SIX6O95475 246 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 F11P03951 625 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CTRB1P17538 263 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PPP2R1BP30154 601 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 UGT2B10P36537 528 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 BDKRB1P46663 353 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TEAD4Q15561 434 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 VITQ6UXI7 678 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 NXPE1Q8N323 547 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RFT1Q96AA3 541 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 NTMT1Q9BV86 223 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PLAGL1Q9UM63 463 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 SNX11Q9Y5W9 270 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PRNPP04156 253 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CBR1P16152 277 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 JUNDP17535 347 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RAB3BP20337 219 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 HOXA9P31269 272 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RFX2P48378 723 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CLCN7P51798 805 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 EPHA5P54756 1037 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TAS2R41P59536 307 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 GPR85P60893 370 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 INSL4Q14641 139 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CTSL3PQ5NE16 218 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 MANEALQ5VSG8 457 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 VN1R3Q9BXE9 311 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ARL6Q9H0F7 186 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RHBGQ9H310 441 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CLMPQ9H6B4 373 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 HPF1Q9NWY4 346 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ELOVL2Q9NXB9 296 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 IL36AQ9UHA7 158 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1W2PRB8 838 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ATG13O75143 517 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 HMGCLP35914 325 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 NUDT1P36639 197 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TAS2R50P59544 299 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 MICAQ29983 383 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 COX20Q5RI15 118 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 GPR26Q8NDV2 337 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 SETD6Q8TBK2 473 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM184CQ9NVA4 438 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 GLOD5A6NK44 160 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 HEPACAM2A8MVW5 462 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ARPC5O15511 151 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 SGCEO43556 437 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 FRS3O43559 492 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PAHP00439 452 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 C1QBP02746 253 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RPS5P46782 204 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CCR6P51684 374 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 KRT78Q8N1N4 520 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 HDDC3Q8N4P3 179 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 DOK4Q8TEW6 326 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PRR14Q9BWN1 585 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 KCNK12Q9HB15 430 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 IL17CQ9P0M4 197 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PPT2Q9UMR5 302 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1W2PPL8 197 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CARNS1A5YM72 827 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 MPZL2O60487 215 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 F8A1P23610 371 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 PSPHP78330 225 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF91Q05481 1191 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 CBLBQ13191 982 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTC1-201ENST00000290378 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms