RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 SPHARQ15513 63 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 EML3Q32P44 896 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 PCID2Q5JVF3 399 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ISCA2Q86U28 154 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 C4orf19Q8IY42 314 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR26Q8NDV2 337 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 OR10A6Q8NH74 314 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 POF1BQ8WVV4 589 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 OSTF1Q92882 214 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 WNT8BQ93098 351 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF599Q96NL3 588 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF559Q9BR84 538 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 NEU3Q9UQ49 428 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 GAB2Q9UQC2 676 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 KCTD3Q9Y597 815 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 DISC1C4P0D8 188 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 HOXA2O43364 376 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 MPZL2O60487 215 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 NBNO60934 754 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 GLP2RO95838 553 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 NFKB1P19838 968 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 EDNRBP24530 442 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SOX3P41225 446 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SUOXP51687 545 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SEMG2Q02383 582 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 GRB14Q14449 540 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 LAPTM4AQ15012 233 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC36A2Q495M3 483 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SGO1Q5FBB7 561 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 C17orf99Q6UX52 265 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 NAA40Q86UY6 237 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 KCTD7Q96MP8 289 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SPSB2Q99619 263 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 AMBNQ9NP70 447 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 COL6A3P12111 3177 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ACOD1A6NK06 481 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 IMPA2O14732 288 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC7A4O43246 635 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 HCRTO43612 131 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 UGDHO60701 494 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 PRAF2O60831 178 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ESR1P03372 595 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 LINC00032P0C843 101 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 CBSLP0DN79 551 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 MPGP29372 298 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SFNP31947 248 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 CBSP35520 551 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 IRS1P35568 1242 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 RFX3P48380 749 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 RAP2BP61225 183 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB33AQ14088 237 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 IL18Q14116 193 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 CSHL1Q14406 222 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SMCO1Q147U7 214 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 NTRK2Q16620 822 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 MANEAQ5SRI9 462 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 TMUB2Q71RG4 321 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 LAS2Q8IYD9 372 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF2E1-201ENST00000283875 IFI44Q8TCB0 444 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms