RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM107Q6UX40 140 aa22.65■■□□□ 1.22
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SH3GL1-201ENST00000269886 BBS10Q8TAM1 723 aa22.65■■□□□ 1.22
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SH3GL1-201ENST00000269886 PRRC1Q96M27 445 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1-201ENST00000269886 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.65■■□□□ 1.22
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SH3GL1-201ENST00000269886 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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SH3GL1-201ENST00000269886 WDR26Q9H7D7 661 aa22.64■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.64■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 AP3D1O14617 1153 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 RCVRNP35243 200 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 OR2B6P58173 313 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 AGBL4Q5VU57 503 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 CTRCQ99895 268 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 EQTNQ9NQ60 294 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 MSL3P1P0C860 447 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 SMSP52788 366 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 IRF4Q15306 451 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 TM9SF4Q92544 642 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 TMCO6Q96DC7 493 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 CMAHPQ9Y471 501 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.62■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 SLC25A46Q96AG3 418 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 SAP130Q9H0E3 1048 aa22.62■■□□□ 1.21
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SH3GL1-201ENST00000269886 BCL2A1Q16548 175 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 RNFT2Q96EX2 444 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 SRRQ9GZT4 340 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 TSPAN19P0C672 248 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 ACADMP11310 421 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 MYL12AP19105 171 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 CERS1P27544 350 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1-201ENST00000269886 TAS2R41P59536 307 aa22.61■■□□□ 1.21
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