RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 IL7P13232 177 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PTPN6P29350 595 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARFIP1P53367 373 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CDK3Q00526 305 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DUSP6Q16828 381 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PLK5Q496M5 336 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ASPGQ86U10 573 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OAFQ86UD1 273 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CACUL1Q86Y37 369 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR2L5Q8NG80 312 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SMARCD2Q92925 531 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARRDC3Q96B67 414 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRQ8 180 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ETHE1O95571 254 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CD22P20273 847 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN31Q12999 210 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MAB21L1Q13394 359 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MLC1Q15049 377 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FANK1Q8TC84 345 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMED9Q9BVK6 235 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MED31Q9Y3C7 131 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PROM1O43490 865 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SCN2BO60939 215 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ITGA10O75578 1167 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SERPINI2O75830 405 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR5F1O95221 314 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACVR2AP27037 513 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BMP8BP34820 402 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SOX3P41225 446 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GIPRP48546 466 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DGKEP52429 567 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ8Q15842 424 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 APH1BQ8WW43 257 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 UBE2FQ969M7 185 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IGLON5A6NGN9 336 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARL6IP5O75915 188 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HK1P19367 917 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM107Q6UX40 140 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RLIMQ9NVW2 624 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 M0R082 166 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ASGR2P07307 311 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A6P31641 620 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GABRA5P31644 462 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RNLSQ5VYX0 342 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR2M4Q96R27 311 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR5M11Q96RB7 305 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF222Q9UK12 451 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 M0R3H8 397 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PLD2O14939 933 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PLOD3O60568 738 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 REM1O75628 298 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CEBPBP17676 345 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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