RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBP1Q9H171 429 aa20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TDP1Q9NUW8 608 aa20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR70Q9NW82 654 aa20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TAC3Q9UHF0 121 aa20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM29Q9UKF5 820 aa20.87■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM157BP0CG42 384 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 MAN2A2P49641 1150 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 RIN1Q13671 783 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 BEX2Q9BXY8 128 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5DC2Q9H857 520 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 MARK1Q9P0L2 795 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CA8P35219 290 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 REEP5Q00765 189 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CNIH2Q6PI25 160 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF366Q8N895 744 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC9A6Q92581 669 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 VWCEQ96DN2 955 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ7Q99807 217 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM30A4D0T7 59 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CCL16O15467 120 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 APOL3O95236 402 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 Q8N402 240 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK12Q9HB15 430 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 COMMD3Q9UBI1 195 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 GNG2P59768 71 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 DPTQ07507 201 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 FAPQ12884 760 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 EFR3AQ14156 821 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TATDN3Q17R31 274 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIQKQ629K1 86 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 UCN3Q969E3 161 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 RGMAQ96B86 450 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ATF6BQ99941 703 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 VEGFDO43915 354 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN7O94888 489 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC6A11P48066 632 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CAV3P56539 151 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.85■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CASKO14936 926 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFS4O43181 175 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 MOSPD3O75425 235 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.933e-6■□□□□ 10
HTATSF1-201ENST00000218364 EVX1P49640 407 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CCR8P51685 355 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 METAP1P53582 386 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TEAD2Q15562 447 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 NIPAL2Q9H841 368 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A087WUU8 490 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRM4P08173 479 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 GZMKP49863 264 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 KHKP50053 298 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 TLE2Q04725 743 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 RPA4Q13156 261 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF77Q15935 545 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.84■□□□□ 0.93
HTATSF1-201ENST00000218364 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms