RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028382.12

Nup35-201, Transcript of Nucleoporin NUP53, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nup35, Length 1,559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35-201ENSMUST00000028382 Nkain1Q9D035 207 aa14.66□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Spns3Q9D232 514 aa14.66□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa14.66□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Btbd2E9PUS2 523 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Vmn2r18E9Q280 788 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Vmn2r9K7N6Z8 848 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 2410141K09RikK7N769 464 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Slc6a6O35316 621 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Cyp2j5O54749 501 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Slc6a18O88576 615 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 ClppO88696 272 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Csf3rP40223 837 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Tgif1P70284 272 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 S100a13P97352 98 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Defb41Q30KP6 65 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 2410002F23RikQ3TE80 284 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Brf2Q3UAW9 420 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Nhlrc4Q3UP44 136 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Adamts4Q8BNJ2 833 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Fam69cQ8BQT2 410 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Gpr22Q8BZL4 432 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Irak4Q8R4K2 459 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Gstt3Q99L20 241 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 MrgprhQ99MT8 321 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Acss1Q99NB1 682 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Ankrd22Q9D3J5 191 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Zdhhc4Q9D6H5 343 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Fam162aQ9D6U8 155 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Slc46a3Q9DC26 460 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 ReckQ9Z0J1 971 aa14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Nup35-201ENSMUST00000028382 Gm8922F6XVS9 199 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Tmem200cJ3QK46 637 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Gm4141K9J7H2 306 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Dbil5O09035 87 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Hsd3b6O35469 373 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Pcsk2P21661 637 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Klrb1aP27811 227 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Tacr1P30548 407 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Rps26P62855 115 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Cct3P80318 545 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Lpcat1Q3TFD2 534 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Slc22a23Q3UHH2 689 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Kcns3Q8BQZ8 491 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Slc35b4Q8CIA5 331 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 St8sia6Q8K4T1 398 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 FggQ8VCM7 436 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Rnf130Q8VEM1 419 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Olfr781Q8VFZ8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Chrm5Q920H4 532 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Maf1Q9D0U6 258 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Lrrc51Q9DAK8 192 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 TesminQ9WTJ6 475 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Tbk1Q9WUN2 729 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Tnrc6aQ3UHK8 1896 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Kif28pD3YXS5 1028 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Sult3a2G5E904 293 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 FkbplO35450 347 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Cd3gP11942 182 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Nkx2-6P43688 289 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Yy2Q3TTC2 378 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 VwceQ3U515 929 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Rfx4Q7TNK1 735 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Klhl13Q80TF4 654 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Yod1Q8CB27 343 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Blzf1Q8R2X8 403 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Satb2Q8VI24 733 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 BollQ924M5 281 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Cyp4f3Q99N16 524 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 P2ry12Q9CPV9 347 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Prl8a9Q9CQ58 241 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Prdm5Q9CXE0 599 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Srd5a3Q9WUP4 330 aa14.64□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Man2a1P27046 1150 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 PlaaP27612 794 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Mmp2P33434 662 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Btbd3P58545 530 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Gngt2Q61017 69 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Klhdc10Q6PAR0 439 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Cd3eapQ76KJ5 399 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Olfr1307Q7TQX1 312 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Slc35d3Q8BGF8 422 aa14.63□□□□□ -0.07
Nup35-201ENSMUST00000028382 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.4 ms