RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PTCHD1Q96NR3 888 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DGAT2Q96PD7 388 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPHS2Q99611 448 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT2B28Q9BY64 529 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TGIF2Q9GZN2 237 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF639Q9UID6 485 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 V9GYQ6 96 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 B4E171 279 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ASNA1O43681 348 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKD3O94806 890 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN7P41732 249 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYBA2P53672 197 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RHAGQ02094 409 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 STPG1Q5TH74 334 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 REEP3Q6NUK4 255 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CBLL1Q75N03 491 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT10Q86SR1 603 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT12Q8IXK2 581 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL25Q8N6Q8 603 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NRG4Q8WWG1 115 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 XAGE5Q8WWM1 108 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RIT1Q92963 219 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7D2Q96RA2 312 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CMKLR1Q99788 373 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PKP2Q99959 881 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 EQTNQ9NQ60 294 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RX2Q9UBL9 471 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPT4Q9Y264 503 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 BCHEP06276 602 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 S1PR1P21453 382 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP1P29972 269 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 DCDP81605 110 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC73Q6P1J9 531 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM19Q96HH6 336 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSFQ9UBX1 484 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS6KA6Q9UK32 745 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TIPRLO75663 272 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RAP2AP10114 183 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 EFNA3P52797 238 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NKG7Q16617 165 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MINDY4Q4G0A6 757 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 GLRX5Q86SX6 157 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LRTOMTQ8WZ04 291 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PYURFQ96I23 114 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF145Q96MT1 663 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 STRADBQ9C0K7 418 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGIXQ9H6Y5 334 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NME6O75414 186 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CBX7O95931 251 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RECKO95980 971 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCN2P51788 898 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNB3Q05901 458 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SYPL1Q16563 259 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ISXQ2M1V0 245 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAP2Q9NPF8 381 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A1Q9NY26 324 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNE3Q9Y6H6 103 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC16AO15027 2179 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM247A6NEH6 219 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 DUXAA6NLW8 204 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf58C9J3I9 102 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF682O95780 498 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF28P17035 718 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 FUT5Q11128 374 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP8Q13202 625 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ERMP1Q7Z2K6 904 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LAPTM4BQ86VI4 370 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A11Q8NCK7 471 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 STT3BQ8TCJ2 826 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS15Q8TE58 950 aa23.23■■□□□ 1.31
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