RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 DAPP1Q9UN19 280 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 FLNCQ14315 2725 aa5.46□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 LRRK2Q5S007 2527 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 A0A088AWK7 358 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MEGF11A6BM72 1044 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 C9JVG2 144 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 PRRG2O14669 202 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MSTNO14793 375 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD28O15084 1053 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 PROM1O43490 865 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ATP8B1O43520 1251 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 LDB3O75112 727 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SLC25A12O75746 678 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 HSPA4LO95757 839 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 IFNA16P05015 189 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 KLK1P06870 262 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SP1P08047 785 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CELA3AP09093 270 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF24P17028 368 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 GSTM2P28161 218 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 HMOX2P30519 316 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SSR2P43308 183 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CYB561P49447 251 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MTTPP55157 894 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 RAB38P57729 211 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TNFRSF17Q02223 184 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 IFT88Q13099 833 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SLAMF1Q13291 335 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ART3Q13508 389 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 PTGR1Q14914 329 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 C3AR1Q16581 482 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CFAP157Q5JU67 520 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM198Q66K66 360 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 XKRXQ6PP77 449 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MCEMP1Q8IX19 187 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CNPY4Q8N129 248 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 EID3Q8N140 333 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 GHDCQ8N2G8 530 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM156Q8N614 296 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MDS2Q8NDY4 140 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TTLQ8NG68 377 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CLHC1Q8NHS4 586 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 UBE2E3Q969T4 207 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MARK4Q96L34 752 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TEX37Q96LM6 180 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 GPR137Q96N19 417 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 KCNC2Q96PR1 638 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SERINC2Q96SA4 455 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 NPAS2Q99743 824 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 C1orf50Q9BV19 199 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 NUF2Q9BZD4 464 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 CHST11Q9NPF2 352 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 SNX6Q9UNH7 406 aa5.45□□□□□ -1.54
LINC00963-215ENST00000622972 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms