RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 GZMKP49863 264 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ETV1P50549 477 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TAS2R50P59544 299 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 B4GALNT1Q00973 533 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 BEST4Q8NFU0 473 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PIGKQ92643 395 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 A0A075B6Q4 140 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TEX46H3BTG2 121 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC16A8O95907 504 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MSL3P1P0C860 447 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CELP19835 753 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CD79BP40259 229 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SMSP52788 366 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LIM2P55344 173 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PFN3P60673 137 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MAP4K2Q12851 820 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FGFBP1Q14512 234 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TEAD4Q15561 434 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MEIOBQ8N635 442 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SETD6Q8TBK2 473 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 UPRTQ96BW1 309 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KCTD7Q96MP8 289 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GINS4Q9BRT9 223 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CD8B2A6NJW9 211 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 QSOX1O00391 747 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GNB5O14775 395 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR1F1O43749 312 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PRKYO43930 277 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NTN1O95631 604 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 IGLV3-27P01718 113 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FCER2P06734 321 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CD8BP10966 210 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LAMP2P13473 410 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 JUPP14923 745 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GDI1P31150 447 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SOX18P35713 384 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KCT2Q8NC54 265 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR7G3Q8NG95 312 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MAFFQ9ULX9 164 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FAM25EA8MYX2 175 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 DVL2O14641 736 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 FFAR1O14842 300 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LYRM1O43325 122 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ADH5P11766 374 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 STAT5AP42229 794 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 RBBP4Q09028 425 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.59□□□□□ -1.35
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