RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598362.1

GRAMD1A-208, Transcript of GRAM domain containing 1A, human

TSL 2

Gene GRAMD1A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MC3R	P41968	323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IDH3A	P50213	366 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NME5	P56597	212 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CLDN8	P56748	225 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MLF1	P58340	268 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ARG2	P78540	354 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MGAT2	Q10469	447 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FUT7	Q11130	342 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HSPB3	Q12988	150 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DUSP8	Q13202	625 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MEP1A	Q16819	746 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CPTP	Q5TA50	214 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM198	Q66K66	360 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CGB2	Q6NT52	195 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM107	Q6UX40	140 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HSDL2	Q6YN16	418 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HPS6	Q86YV9	775 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BEST3	Q8N1M1	668 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR8K3	Q8NH51	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NUBPL	Q8TB37	319 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DPY30	Q9C005	99 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR10A5	Q9H207	317 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ABI3	Q9P2A4	366 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362		A0A0G2JND7	137 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR6C76	A6NM76	312 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GABRR3	A8MPY1	467 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362		C9JVG2	144 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FCHO1	O14526	889 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UBD	O15205	165 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DPM1	O60762	260 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRAMEF2	O60811	474 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COQ9	O75208	318 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	WDPCP	O95876	746 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	F10	P00742	488 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IFI6	P09912	130 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LAMP1	P11279	417 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IDO1	P14902	403 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GPX3	P22352	226 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MPI	P34949	423 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GPC1	P35052	558 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLC37A1	P57057	533 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	STX1B	P61266	288 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UFM1	P61960	85 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RNF4	P78317	190 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MAP4K2	Q12851	820 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GSTA3	Q16772	222 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ACER2	Q5QJU3	275 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29

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