RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 TTC26A0AVF1 554 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CTAGE15A4D2H0 777 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM172BPA6NC97 362 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 WASHC1A8K0Z3 465 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 SNNO75324 88 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 BMP15O95972 392 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 IGKV2-30P06310 120 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 FHP07954 510 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 T-ENOLP0DO92 83 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 ERVK-10P10266 1014 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 EDNRAP25101 427 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 PEX19P40855 299 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 HTR5AP47898 357 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 AIF1P55008 147 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 OSTNP61366 133 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CCNA1P78396 465 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 BEX3Q00994 111 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 IL9RQ01113 521 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 HYAL1Q12794 435 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 ZP4Q12836 540 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC01620Q4KN68 170 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 LUZP1Q86V48 1076 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 AZIN2Q96A70 460 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CPXM1Q96SM3 734 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 OMDQ99983 421 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 C1orf123Q9NWV4 160 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 GPR83Q9NYM4 423 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 KLRF1Q9NZS2 232 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.59□□□□□ -1.67
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A0U1RQS6 177 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ASB14A6NK59 587 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 A8MU76 341 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 H0YL77 283 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 PRRG1O14668 218 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 INPP4BO15327 924 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 TNFSF12O43508 249 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 B4GALT2O60909 372 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 NXPH2O95156 264 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 IL1BP01584 269 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 PRSS1P07477 247 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 GSTT2P0CG29 244 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 GSTT2BP0CG30 244 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF44P15621 663 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 PGFP49763 221 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 PAX9P55771 341 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 CUL2Q13617 745 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ENPP2Q13822 863 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 IDI1Q13907 227 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC17A1Q14916 467 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKFN1Q8N957 763 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC77Q9BR77 488 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNK13Q9HB14 408 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 GHRLQ9UBU3 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 C2CD2Q9Y426 696 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 LRP12Q9Y561 859 aa4.58□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 SYNJ2O15056 1496 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A0A6YYD4 124 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A1W2PR80 420 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 C15orf61A6NNL5 157 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 P2RY10O00398 339 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 CYB561D2O14569 222 aa4.57□□□□□ -1.68
PIK3C3-211ENST00000589550 ACOT8O14734 319 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms