RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RTL10Q7L3V2 364 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 FAM129CQ86XR2 697 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 OR8K5Q8NH50 307 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 GGHQ92820 318 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 LGALS12Q96DT0 336 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 COL21A1Q96P44 957 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 NFATC1O95644 943 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 VITQ6UXI7 678 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SMIM30A4D0T7 59 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 ISPDA4D126 451 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 ANHXE9PGG2 379 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 GABARAPL2P60520 117 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 ST3GAL4Q11206 333 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 MSANTD3Q96H12 275 aa14.25□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 UCK2Q9BZX2 261 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.25□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 KEAP1Q14145 624 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 MED22Q15528 200 aa14.24□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.24□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 BRD7Q9NPI1 651 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 LEUTXA8MZ59 168 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 M0R082 166 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.13
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CTIF-205ENST00000587860 BSGP35613 385 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SSR2P43308 183 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 CD83Q01151 205 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 IRF4Q15306 451 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 MICAQ29983 383 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 PHC2Q8IXK0 858 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 STX19Q8N4C7 294 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 Q96MT0 163 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 CAPN10Q9HC96 672 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 MYNNQ9NPC7 610 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 NUP50Q9UKX7 468 aa14.24□□□□□ -0.13
CTIF-205ENST00000587860 SNX7Q9UNH6 387 aa14.24□□□□□ -0.13
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