RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ISCA2Q86U28 154 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PP55 124 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 K7ERQ8 282 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 DRD2P14416 443 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 GNRHRP30968 328 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PNCKQ6P2M8 343 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP12Q02952 1782 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM64A6NGJ6 449 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PRKYO43930 277 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RHOP08100 348 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SGCAQ16586 387 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NINJ1Q92982 152 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SGTBQ96EQ0 304 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PHB2Q99623 299 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 OR10A4Q9H209 315 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PEX12O00623 359 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD6Q86V97 674 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 DOK4Q8TEW6 326 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MAL2Q969L2 176 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 E2F3O00716 465 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BMP2P12643 396 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ABCG5Q9H222 651 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NR4A2P43354 598 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NTRK2Q16620 822 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 DPH7Q9BTV6 452 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BIN3Q9NQY0 253 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 A6NHS1 94 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 FRS2Q8WU20 508 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BPIP17213 487 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZXDBP98169 803 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 APCDD1Q8J025 514 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 FIZ1Q96SL8 496 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BMXP51813 675 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 INAVAQ3KP66 663 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ELOCQ15369 112 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RTP4Q96DX8 246 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM19Q96HH6 336 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RAD9AQ99638 391 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BOCQ9BWV1 1114 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SYT4Q9H2B2 425 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 KRBA1A5PL33 1030 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 UNCXA6NJT0 531 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 WDR92Q96MX6 357 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 INPP5KQ9BT40 448 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 H7C417 338 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 RAD51DO75771 328 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 MAS1P04201 325 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ADORA3P0DMS8 318 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 AGTR1P30556 359 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 HTR6P50406 440 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R38P59533 333 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 APOFQ13790 326 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 OR4K3Q96R72 315 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 BRF2Q9HAW0 419 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SLC5A8Q8N695 610 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ACBD7Q8N6N7 88 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO27Q8NI29 283 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF559Q9BR84 538 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 M0R129 80 aa20.33■□□□□ 0.84
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