RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 PAQR7Q86WK9 346 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 CEP97Q8IW35 865 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 OR2L3Q8NG85 312 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.51□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 CT55Q8WUE5 264 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa4.51□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 WBP1Q96G27 269 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 CFAP36Q96G28 342 aa4.51□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 FUT8Q9BYC5 575 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 DPH5Q9H2P9 285 aa4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 GSAPA4D1B5 854 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 B9A039 149 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 DSCR3O14972 297 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF749O43361 778 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 SCRG1O75711 98 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 PRB1P04280 392 aa4.5□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 CBSP35520 551 aa4.5□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 NPAS1Q99742 590 aa4.5□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 RARRES3Q9UL19 164 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.5□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 WIPF3A6NGB9 483 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 C21orf140B9A014 251 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 K7EM74 188 aa4.49□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 RRHO14718 337 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 SLC16A5O15375 505 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 TAPBPO15533 448 aa4.49□□□□□ -1.69
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