RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	FBXO30	Q8TB52	745 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	PSME2	Q9UL46	239 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395		V9GYQ6	96 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SPACA6	W5XKT8	324 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FBN2	P35556	2912 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PS29	197 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395		H3BMH7	237 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SGK494	L7N484	410 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CYR61	O00622	381 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FOXS1	O43638	330 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	TPST1	O60507	370 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJB6	O75190	326 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	RDH16	O75452	317 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	PRKD3	O94806	890 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MED26	O95402	600 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FH	P07954	510 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MSL3P1	P0C860	447 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	RAP2A	P10114	183 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ARAF	P10398	606 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ACADS	P16219	412 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FAS	P25445	335 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	KDELR2	P33947	212 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MPI	P34949	423 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	GPC1	P35052	558 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MAGEA8	P43361	318 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CASP9	P55211	416 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	RAB38	P57729	211 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	DSTN	P60981	165 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SKP1	P63208	163 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	HSD11B2	P80365	405 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CLN3	Q13286	438 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SQSTM1	Q13501	440 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SCARB2	Q14108	478 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FAM53B	Q14153	422 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	KCNAB1	Q14722	419 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ATP6AP1	Q15904	470 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	WLS	Q5T9L3	541 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC80	Q76M96	950 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	KMT5C	Q86Y97	462 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	D2HGDH	Q8N465	521 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ANKFN1	Q8N957	763 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	EXTL1	Q92935	676 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MAL2	Q969L2	176 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	MOAP1	Q96BY2	351 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TPM1-231	ENST00000561395	RNF145	Q96MT1	663 aa		7.05	□□□□□ -1.28

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