RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SRM	P19623	302 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CBL	P22681	906 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	UCP1	P25874	307 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SRD5A2	P31213	254 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAM1	P38567	509 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NAMPT	P43490	491 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GEM	P55040	296 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	C21orf59	P57076	290 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC8A3	P57103	927 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DAOA	P59103	153 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	HERVK_113	P63132	956 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-8	P63133	956 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPE	Q05469	1076 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DMPK	Q09013	629 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MERTK	Q12866	999 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BNIP1	Q12981	228 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CUL1	Q13616	776 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH18	Q13634	790 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SPHAR	Q15513	63 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SYPL1	Q16563	259 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	AANAT	Q16613	207 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PHKG1	Q16816	387 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01620	Q4KN68	170 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	XKR7	Q5GH72	579 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4A47	Q6IF82	309 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ANO5	Q75V66	913 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LONP2	Q86WA8	852 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MICU2	Q8IYU8	434 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4L1	Q8NH43	312 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TMED6	Q8WW62	240 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT8	Q92599	483 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA4D	Q92854	862 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SGK3	Q96BR1	496 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNDC15	Q96J42	360 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ART5	Q96L15	291 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPER2	Q96P56	530 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DUX5	Q96PT3	197 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NDN	Q99608	321 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MIS12	Q9H081	205 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RGCC	Q9H4X1	137 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM51	Q9NW97	253 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF639	Q9UID6	485 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TINAG	Q9UJW2	476 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR81	Q562E7	1941 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRC	P08575	1304 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		2.51	□□□□□ -2.01

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