RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	COL4A2	P08572	1712 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667		A6NCN8	305 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM64B	A6NI03	449 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	METTL12	A8MUP2	240 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	TAF4	O00268	1085 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	S100A5	P33763	92 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CNR2	P34972	360 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	BTN3A2	P78410	334 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ALG11	Q2TAA5	492 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	OR2L13	Q8N349	312 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ISOC1	Q96CN7	298 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	MUS81	Q96NY9	551 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	MYOC	Q99972	504 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	MMP27	Q9H306	513 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		8.01	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667		E9PQ18	207 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	TLR4	O00206	839 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	THEGL	P0DJG4	465 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ACTC1	P68032	377 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ACTA1	P68133	377 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	MAP4K2	Q12851	820 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	GPR50	Q13585	617 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF366	Q8N895	744 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	BMF	Q96LC9	184 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	SLC31A1	O15431	190 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	DUX1	O43812	170 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PRAMEF4	O60810	478 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	AIFM1	O95831	613 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	BCHE	P06276	602 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	GABRG2	P18507	467 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CBL	P22681	906 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	FPR3	P25089	353 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CD38	P28907	300 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	LIMS1	P48059	325 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CDH12	P55289	794 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	DEFA1	P59665	94 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	DEFA3	P59666	94 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	TSPAN31	Q12999	210 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ADCK1	Q86TW2	530 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	SATL1	Q86VE3	508 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CEP76	Q8TAP6	659 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	VMP1	Q96GC9	406 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	MTG2	Q9H4K7	406 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	KCNK12	Q9HB15	430 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667		Q9N2J8	555 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PDE7B	Q9NP56	450 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	OR1A2	Q9Y585	309 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	HAT1	O14929	419 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CTNS	O60931	367 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CDH3	P22223	829 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	XK	P51811	444 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	RAB40B	Q12829	278 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	C2orf27A	Q580R0	203 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	FLCN	Q8NFG4	579 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	PIK3R3	Q92569	461 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	TAMM41	Q96BW9	452 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	FAM122A	Q96E09	287 aa		8	□□□□□ -1.13
RBM23-233	ENST00000557667	ELP4	Q96EB1	424 aa		8	□□□□□ -1.13

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