RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557168.1

TRAV30-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 30, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV30, Length 337 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30-201ENST00000557168 LRRTM2O43300 516 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HS6ST1O60243 411 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ZG16O60844 167 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 INMTO95050 263 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 GUCA1CO95843 209 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ELFN1P0C7U0 828 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 IL7RP16871 459 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HIST1H2ADP20671 130 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CYP2A7P20853 494 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 AGXTP21549 392 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 IDSP22304 550 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TACR1P25103 407 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 PCGF2P35227 344 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 GRK3P35626 688 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TRIM23P36406 574 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 MMP12P39900 470 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ETV3P41162 512 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HNF4AP41235 474 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CDKN2CP42773 168 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 KIR3DL1P43629 444 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 GPR3P46089 330 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ASMTP46597 345 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ARHGDIAP52565 204 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HMGA2P52926 109 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 PNLIPRP1P54315 467 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TUBA1BP68363 451 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 RELAQ04206 551 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 RBBP4Q09028 425 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ELP6Q0PNE2 266 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 IL10RAQ13651 578 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 NR1D2Q14995 579 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SPCS2Q15005 226 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 OXA1LQ15070 435 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 NPTX1Q15818 432 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 NEDD8Q15843 81 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 UGT8Q16880 541 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SGO1Q5FBB7 561 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 LRRC66Q68CR7 880 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SLC6A19Q695T7 634 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ANKRD34AQ69YU3 496 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 LCN10Q6JVE6 187 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 NIPAL1Q6NVV3 410 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ERAP2Q6P179 960 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SPESP1Q6UW49 350 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 USP45Q70EL2 814 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TUBA1AQ71U36 451 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CCDC80Q76M96 950 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TSPAN33Q86UF1 283 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 LACC1Q8IV20 430 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HS3ST5Q8IZT8 346 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 MFSD4AQ8N468 514 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SVOPQ8N4V2 548 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SLC15A4Q8N697 577 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 OR56A3Q8NH54 315 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 OR10G6Q8NH81 332 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ATL1Q8WXF7 558 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SGCDQ92629 289 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ITFG2Q969R8 447 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 POM121Q96HA1 1249 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 CCDC138Q96M89 665 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 OR6C1Q96RD1 312 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HBEGFQ99075 208 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 EPYCQ99645 322 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 NUDT9Q9BW91 350 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 BTBD2Q9BX70 525 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 WDR26Q9H7D7 661 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 SCN3BQ9NY72 215 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAV30-201ENST00000557168 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms