RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 OR51I1Q9H343 314 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 C17orf105B2RV13 164 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 IDSB3KWA1 339 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 HMGN4O00479 90 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 GSTA4O15217 222 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 PLOD3O60568 738 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 HEXBP07686 556 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 S1PR1P21453 382 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 PRIM2P49643 509 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 MAP4K2Q12851 820 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 BNIP2Q12982 314 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 FADDQ13158 208 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 DUSP8Q13202 625 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 SERTAD2Q14140 314 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 VMACQ2NL98 169 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 GALNT10Q86SR1 603 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 SPATA24Q86W54 205 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 SFXN5Q8TD22 340 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 ZNF675Q8TD23 568 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 JADE3Q92613 823 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 ZPBPQ9BS86 351 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 DDA1Q9BW61 102 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 C3orf18Q9UK00 162 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.52□□□□□ -0.88
SRP54-208ENST00000555557 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 CXCR6O00574 342 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 CBX7O95931 251 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 GGT1P19440 569 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 AQP1P29972 269 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 EMP2P54851 167 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 DSTNP60981 165 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 MAP7Q14244 749 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 FXNQ16595 210 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SPATS1Q496A3 300 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SLC9A6Q92581 669 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 NCLNQ969V3 563 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 MOAP1Q96BY2 351 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SPRY4Q9C004 299 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 NTMQ9P121 344 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 PADI1Q9ULC6 663 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 A0A087WV62 115 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 DLGAP3O95886 979 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 ALBP02768 609 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SLC5A2P31639 672 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 LRGUKQ96M69 825 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 OR7D2Q96RA2 312 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 CRB3Q9BUF7 120 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 ZNF639Q9UID6 485 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-208ENST00000555557 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms