RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	GEM	P55040	296 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CSNK2B	P67870	215 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MEF2D	Q14814	521 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	AGK	Q53H12	422 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FGD3	Q5JSP0	725 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ARMCX2	Q7L311	632 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CACUL1	Q86Y37	369 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC185	Q8N715	623 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GANC	Q8TET4	914 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DYRK2	Q92630	601 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CASP10	Q92851	521 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB7B	Q96AH8	199 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MEIS3	Q99687	375 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		U3KQV3	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DOCK7	Q96N67	2140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087WZY1	265 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	B4GAT1	O43505	415 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVK-10	P10266	1014 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	AADAC	P22760	399 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GLRA1	P23415	457 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPC1	P48995	793 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LIMK2	P53671	638 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MTTP	P55157	894 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	BACE1	P56817	501 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SGCG	Q13326	291 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	VGLL4	Q14135	290 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1C1	Q15619	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	C3AR1	Q16581	482 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ACCSL	Q4AC99	568 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LIPJ	Q5W064	366 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF524	Q96C55	264 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	IL12RB2	Q99665	862 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CARD6	Q9BX69	1037 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	WWP1	Q9H0M0	922 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTR8	Q9H981	624 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CD209	Q9NNX6	404 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	STK36	Q9NRP7	1315 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0U1RQV5	110 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DENND3	A2RUS2	1198 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SHISA7	A6NL88	538 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RY10	O00398	339 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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