RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	WWP2	O00308	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	T	O15178	435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ACOX3	O15254	700 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	PDPK1	O15530	556 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	AKAP10	O43572	662 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	PSMG1	O95456	288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	PTGR1	Q14914	329 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CPTP	Q5TA50	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SPINK14	Q6IE38	97 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TESC	Q96BS2	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ELP4	Q96EB1	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860		A8MVJ9	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SLC28A2	O43868	658 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	NME2P1	O60361	137 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	COQ9	O75208	318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SLC25A12	O75746	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SOX30	O94993	753 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	LRAT	O95237	230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	KIT	P10721	976 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	GPX3	P22352	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	NME2	P22392	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	EPHA3	P29320	983 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	DIO3	P55073	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	NRG3	P56975	720 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TLE1	Q04724	770 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	LTB4R	Q15722	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	RTL4	Q6ZR62	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	UPK1A	O00322	258 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	OR6B1	O95007	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	RASAL1	O95294	804 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	LAMP1	P11279	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	IDO1	P14902	403 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	SOX3	P41225	446 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	DUSP8	Q13202	625 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	NTRK2	Q16620	822 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	GSTA3	Q16772	222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-223	ENST00000538860	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms