RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 THSD1Q9NS62 852 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 BRINP1O60477 761 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 ETFAP13804 333 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 SPINK2P20155 84 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 MATN1P21941 496 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 ME2P23368 584 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 SSTR4P31391 388 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP7Q14244 749 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 OR2L13Q8N349 312 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 KLK13Q9UKR3 277 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 USP22Q9UPT9 525 aa24.72■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 CFAP73A6NFT4 308 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 PLOD3O60568 738 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 GPX2P18283 190 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 CD82P27701 267 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 SOX18P35713 384 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 STAT5AP42229 794 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 GSK3BP49841 420 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 VAC14Q08AM6 782 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 CTHRC1Q96CG8 243 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 C16orf58Q96GQ5 468 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 EPS8L2Q9H6S3 715 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 TCFL5Q9UL49 500 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 AP3M1Q9Y2T2 418 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.71■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A087WV62 115 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 UMODP07911 640 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 GALNSP34059 522 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 PRIM2P49643 509 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 DNASE1L3Q13609 305 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 OR2T12Q8NG77 320 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF583Q96ND8 569 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 MS4A4EQ96PG1 132 aa24.7■■□□□ 1.55
NDUFS3-211ENST00000533507 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 CAMK2BQ13554 666 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 FHL5Q5TD97 284 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 OR5D16Q8NGK9 328 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC9A6Q92581 669 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 OR51I1Q9H343 314 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 CD300AQ9UGN4 299 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 EGFL7Q9UHF1 273 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC7A8Q9UHI5 535 aa24.7■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 CIB2O75838 187 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 CBX7O95931 251 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 NUDT7P0C024 238 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 HORMAD2Q8N7B1 307 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 OR14A16Q8NHC5 309 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC2A12Q8TD20 617 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 NKD1Q969G9 470 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 OR10A5Q9H207 317 aa24.69■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SPTBN2O15020 2390 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 COQ9O75208 318 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 S1PR1P21453 382 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 OTX2P32243 289 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 MVDP53602 400 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 FADDQ13158 208 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 TGIF1Q15583 401 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 PGM2L1Q6PCE3 622 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SERPINA11Q86U17 422 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF321PQ8N8H1 164 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB8BQ92930 207 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 LPAR4Q99677 370 aa24.68■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 C21orf140B9A014 251 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 GSTA4O15217 222 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 OR12D1P0DN82 309 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 F8A1P23610 371 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 DSTNP60981 165 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM205Q6UW68 189 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 MAL2Q969L2 176 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 GIMAP5Q96F15 307 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 GPR87Q9BY21 358 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 ACTRT3Q9BYD9 372 aa24.67■■□□□ 1.54
NDUFS3-211ENST00000533507 NTMQ9P121 344 aa24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms