RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TSLPQ969D9 159 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ZPBPQ9BS86 351 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PISDQ9UG56 409 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MAN2A2P49641 1150 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PRIM2P49643 509 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPK10P53779 464 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DSTNP60981 165 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DUSP8Q13202 625 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TAAR9Q96RI9 348 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 EQTNQ9NQ60 294 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 V9GYQ6 96 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PLOD3O60568 738 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ONECUT2O95948 504 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ANPEPP15144 967 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 GABREP78334 506 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP4K2Q12851 820 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 VEZF1Q14119 521 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO30Q8TB52 745 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF675Q8TD23 568 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MOAP1Q96BY2 351 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM15Q9C019 465 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF639Q9UID6 485 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 KLK13Q9UKR3 277 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 WASF3Q9UPY6 502 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OR10H2O60403 315 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 STAMBPO95630 424 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TFPTP0C1Z6 253 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ARAFP10398 606 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 AQP1P29972 269 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 KDELR2P33947 212 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PCGF2P35227 344 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 STT3AP46977 705 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PRR5P85299 388 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 NKG7Q16617 165 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 LILRA2Q8N149 483 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 NCLNQ969V3 563 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM162AQ96A26 154 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DDA1Q9BW61 102 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A087WV62 115 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MEN1O00255 615 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 BAG2O95816 211 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CBX7O95931 251 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINA1P01009 418 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 IL10P22301 178 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC7A1P30825 629 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 AP2B1P63010 937 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CDK6Q00534 326 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CAMK2BQ13554 666 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SCARB2Q14108 478 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MYBPC3Q14896 1274 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.48■□□□□ 0.87
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