RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	RFK	Q969G6	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CR1	P17927	2039 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636		E9PMD0	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DHH	O43323	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HUS1	O60921	280 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MOCS3	O95396	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	LGI1	O95970	557 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HMBS	P08397	361 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT19	P08727	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PRPS2	P11908	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ADRA2C	P18825	462 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC6A2	P23975	617 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ACOT2	P49753	483 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	NUMB	P49757	651 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MXRA7	P84157	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	PTER	Q96BW5	349 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SSX3	Q99909	188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MECR	Q9BV79	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A087WWL8	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PPW3	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PABPC1-223	ENST00000523636	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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