RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520036.1

ACTBP6-201, Transcript of actin, beta pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP6, Length 1,090 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP6-201ENST00000520036 MC3RP41968 323 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 PPICP45877 212 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 DGKQP52824 942 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 NRG3P56975 720 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 PHC1P78364 1004 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TLR1Q15399 786 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 FHL5Q5TD97 284 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 BORAQ6PGQ7 559 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TAGAPQ8N103 731 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 GALNT16Q8N428 558 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TM9SF4Q92544 642 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 UCN3Q969E3 161 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 NCLNQ969V3 563 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 VPS33AQ96AX1 596 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 NEURL3Q96EH8 262 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 BTBD9Q96Q07 612 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 OR10A5Q9H207 317 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SERHLQ9NQF3 203 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.48□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 EVPLLA8MZ36 301 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TAF4O00268 1085 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CEACAM4O75871 244 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CBX7O95931 251 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SFTPCP11686 197 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 COX4I1P13073 169 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 NAGAP17050 411 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CAPN3P20807 821 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 DRD5P21918 477 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ITGA3P26006 1051 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 RNF4P78317 190 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 RHDQ02161 417 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 FADDQ13158 208 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 GNA13Q14344 377 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 LTB4RQ15722 352 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 MEP1AQ16819 746 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ST3GAL2Q16842 350 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SAXO2Q658L1 398 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TMEM107Q6UX40 140 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SNX32Q86XE0 403 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SHISA5Q8N114 240 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 NUP43Q8NFH3 380 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 OR7G2Q8NG99 324 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 PMM1Q92871 262 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 AGAP4Q96P64 663 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 LMF1Q96S06 567 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 STACQ99469 402 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 RNF32Q9H0A6 362 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTBP6-201ENST00000520036 Q9N2J8 555 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms