RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 G2E3Q7L622 706 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GPBP1Q86WP2 473 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TMC8Q8IU68 726 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SYNE4Q8N205 404 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 STK40Q8N2I9 435 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NPIPB3Q92617 1050 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LPAR1Q92633 364 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LHX4Q969G2 390 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TSSK3Q96PN8 268 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 RASL10BQ96S79 203 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NICN1Q9BSH3 213 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 COPS4Q9BT78 406 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR2AG1Q9H205 316 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ACTL8Q9H568 366 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 WDR45Q9Y484 360 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NUP155O75694 1391 aa6.8□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MCIDASD6RGH6 385 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 I6L893 689 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CYB561D2O14569 222 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM12O43184 909 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 VAPBO95292 243 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 VNN1O95497 513 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ETHE1O95571 254 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GH2P01242 217 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LYL1P12980 280 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HGFP14210 728 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SDHBP21912 280 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ME2P23368 584 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC6A8P48029 635 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MTHFSP49914 203 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MLF1P58340 268 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CCL7P80098 99 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MGAT3Q09327 533 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TCF15Q12870 199 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ITIH4Q14624 930 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NFKBIBQ15653 356 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NPTX1Q15818 432 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC36A2Q495M3 483 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL12Q53G59 568 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 AGKQ53H12 422 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 C4orf22Q6V702 233 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MOB2Q70IA6 237 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ELMOD1Q8N336 334 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 BEST2Q8NFU1 509 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 NEK7Q8TDX7 302 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 GGHQ92820 318 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM2Q99965 735 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SOX7Q9BT81 388 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.79□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF98A6NK75 572 aa6.78□□□□□ -1.32
PDCD4-211ENST00000498367 SMLR1H3BR10 107 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms