RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	FREM3	P0C091	2139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487		B4DXG7	233 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ADAM10	O14672	748 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	KIT	P10721	976 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	LAMP1	P11279	417 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	G6PD	P11413	515 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MC3R	P41968	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CORO7	P57737	925 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PHC1	P78364	1004 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	BIK	Q13323	160 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487		C9JVG2	144 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	UPK1A	O00322	258 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FCHO1	O14526	889 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	SEMA7A	O75326	666 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PSMG1	O95456	288 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CHEK2	O96017	543 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CD1E	P15812	388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PIGA	P37287	484 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	DNASE1L1	P49184	302 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MEOX1	P50221	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FBXW4	P57775	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	KCNK10	P57789	538 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	HSF1	Q00613	529 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FOXO1	Q12778	655 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PEX1	O43933	1283 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	TBX19	O60806	448 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	RASAL1	O95294	804 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	EPHA3	P29320	983 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	IL12A	P29459	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	WNT3	P56703	355 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	EMX2	Q04743	252 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM198	Q66K66	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	NR4A3	Q92570	626 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	ART5	Q96L15	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MARK4	Q96L34	752 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIZ1-222	ENST00000491487	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms