RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491086.5

RNF13-215, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 2

Gene RNF13, Length 1,104 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-215	ENST00000491086	ALG2	Q9H553	416 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	PCSK5	Q92824	1860 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	KLK10	O43240	276 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	EMC8	O43402	210 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	DNAJA2	O60884	412 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	SLITRK5	O94991	958 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	CBX7	O95931	251 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	CLPS	P04118	112 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	NUDT7	P0C024	238 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	SLC13A2	Q13183	592 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	BIK	Q13323	160 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	12.09	□□□□□ -0.47	4e-6	■■■■□ 21.5
RNF13-215	ENST00000491086	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	RNF130	Q86XS8	419 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	DOK4	Q8TEW6	326 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	ASB9	Q96DX5	294 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RNF13-215	ENST00000491086	EVPLL	A8MZ36	301 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	HRK	O00198	91 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	STK17B	O94768	372 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	KRT75	O95678	551 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	ETFA	P13804	333 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	SOAT1	P35610	550 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	MAGEA8	P43361	318 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CASP9	P55211	416 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	ACTR3	P61158	418 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	FUT7	Q11130	342 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	FADD	Q13158	208 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CLN3	Q13286	438 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CCNI	Q14094	377 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	SERTAD2	Q14140	314 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	NUP43	Q8NFH3	380 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	MOAP1	Q96BY2	351 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	PIF1	Q9H611	641 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	WDR54	Q9H977	334 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	ITPR1	Q14643	2758 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	IDS	B3KWA1	339 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	HMGN4	O00479	90 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	DDAH2	O95865	285 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	IGKV3-11	P04433	115 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CYC1	P08574	325 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	GGT1	P19440	569 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	ATP6V1B2	P21281	511 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	NT5E	P21589	574 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	GPC1	P35052	558 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	GPR143	P51810	404 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	CRYBA2	P53672	197 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	TLE3	Q04726	772 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	STX4	Q12846	297 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	BNIP2	Q12982	314 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	LCN8	Q6JVE9	175 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	TMEM205	Q6UW68	189 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	IFNE	Q86WN2	208 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF13-215	ENST00000491086	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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