RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DEPP	Q9NTK1	212 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP1	Q9NVV9	213 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf109	Q9NX04	203 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TINAG	Q9UJW2	476 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		15.96	■□□□□ 0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS44	E7EML9	344 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO45	P0C2W1	286 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00032	P0C843	101 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CFL2	Q9Y281	166 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		15.95	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM10	O14672	748 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BCKDK	O14874	412 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP8B1	O43520	1251 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HS6ST1	O60243	411 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HCN1	O60741	890 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN14	O95500	239 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DRD2	P14416	443 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CHN1	P15882	459 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NAGA	P17050	411 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPH2	P23942	346 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK1	P28482	360 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R2A	P63151	447 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ID2	Q02363	134 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXO1	Q12778	655 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TTMP	Q5BVD1	217 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPD8	Q6UX82	237 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ERP27	Q96DN0	273 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	APIP	Q96GX9	242 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF12	Q96QT6	1004 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		15.94	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GTH9	108 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PGRMC2	O15173	223 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP1B1	P05026	303 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR1E	P28566	365 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGER1	P34995	402 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH9A1	P49189	494 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	XK	P51811	444 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-8	P63133	956 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PSPH	P78330	225 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	BST1	Q10588	318 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP4K2	Q12851	820 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NTRK2	Q16620	822 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB5	Q8WWX0	329 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		15.93	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CREBBP	Q92793	2442 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		15.92	■□□□□ 0.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		15.92	■□□□□ 0.14

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