RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FUT7Q11130 342 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 HSPB3Q12988 150 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 EXT1Q16394 746 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LINC00303Q3SY05 128 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SLC2A7Q6PXP3 512 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DHDDSQ86SQ9 333 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR2L13Q8N349 312 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 LRRC58Q96CX6 371 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 RCN3Q96D15 328 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ELP4Q96EB1 424 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 FBXL20Q96IG2 436 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CGREF1Q99674 301 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ZNF700Q9H0M5 742 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 GIN1Q9NXP7 522 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SAGE2PA6NJ88 616 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C17orf105B2RV13 164 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TGFBR3LH3BV60 316 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 AIM2O14862 343 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF2O60811 474 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DNAJA2O60884 412 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CREG1O75629 220 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CBX6O95503 412 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 AGR2O95994 175 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 FAM87AP0C7U9 286 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PTPN6P29350 595 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NUDT2P50583 147 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MXRA7P84157 204 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ID2Q02363 134 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MGAT2Q10469 447 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 FADDQ13158 208 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TGIF1Q15583 401 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SFT2D3Q587I9 215 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NDUFAF7Q7L592 441 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 RETREG3Q86VR2 466 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD46Q86W74 232 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PRSS58Q8IYP2 241 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR9A2Q8NGT5 310 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR8K3Q8NH51 312 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TSLPQ969D9 159 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NEURL3Q96EH8 262 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD27Q96NW4 1050 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NPAS2Q99743 824 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PRODH2Q9UF12 536 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SCN3AQ9NY46 2000 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DUXAA6NLW8 204 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 B2RBV5 119 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CLIC1O00299 241 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PEX12O00623 359 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PSMG1O95456 288 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 GP1BBP13224 206 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PRIM2P49643 509 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DCAF7P61962 342 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 DUSP2Q05923 314 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 TP53BP2Q13625 1128 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN26Q16670 478 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 ZNF750Q32MQ0 723 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 RUNDC3AQ59EK9 446 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 FHL5Q5TD97 284 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SAXO2Q658L1 398 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 C17orf47Q8NEP4 570 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 NUP43Q8NFH3 380 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-211ENST00000488243 OR1N1Q8NGS0 311 aa10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms