RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.7□□□□□ -0.38
HDLBP-241ENST00000487169 ENPP4Q9Y6X5 453 aa12.7□□□□□ -0.38
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HDLBP-241ENST00000487169 HK3P52790 923 aa12.7□□□□□ -0.38
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HDLBP-241ENST00000487169 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
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HDLBP-241ENST00000487169 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
HDLBP-241ENST00000487169 C5orf51A6NDU8 294 aa12.68□□□□□ -0.38
HDLBP-241ENST00000487169 UNC119BA6NIH7 251 aa12.68□□□□□ -0.38
HDLBP-241ENST00000487169 VSTM2BA6NLU5 285 aa12.68□□□□□ -0.38
HDLBP-241ENST00000487169 AREL1O15033 823 aa12.68□□□□□ -0.38
HDLBP-241ENST00000487169 RDH16O75452 317 aa12.68□□□□□ -0.38
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