RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		9.07	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101		A0A0G2JN53	185 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	HYKK	A2RU49	373 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	TTC36	A6NLP5	189 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	FAM170B	A6NMN3	283 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	TLR4	O00206	839 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	SLC1A7	O00341	560 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PRAMEF10	O60809	474 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CTSV	O60911	334 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	COQ9	O75208	318 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	UBXN7	O94888	489 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CLIC3	O95833	236 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	ANGPTL1	O95841	491 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	C1QC	P02747	245 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	ATP1B1	P05026	303 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	GUSB	P08236	651 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	OR12D1	P0DN82	309 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PRKAR1B	P31321	381 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	IFNGR2	P38484	337 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CDH12	P55289	794 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	RAB38	P57729	211 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	IL5RA	Q01344	420 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	BIK	Q13323	160 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	EIPR1	Q53HC9	387 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	MLIP	Q5VWP3	458 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	C18orf63	Q68DL7	685 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CDC73	Q6P1J9	531 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM107	Q6UX40	140 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	GALNT10	Q86SR1	603 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM73	Q86UV7	250 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	OR2L13	Q8N349	312 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	AMER3	Q8N944	861 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	KCT2	Q8NC54	265 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	NUP43	Q8NFH3	380 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CLDN23	Q96B33	292 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	COL21A1	Q96P44	957 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	POLE3	Q9NRF9	147 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	C5AR2	Q9P296	337 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	SATB2	Q9UPW6	733 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	IFT52	Q9Y366	437 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	MAST4	O15021	2626 aa		9.06	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101		A0A1W2PRQ8	180 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	TLCD2	A6NGC4	264 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101		B4DGG1	531 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	LMO7DN	F2Z398	122 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PGRMC2	O15173	223 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PPM1D	O15297	605 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	P2RX6	O15547	441 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PLOD3	O60568	738 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	UGT2B17	O75795	530 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	DIRAS1	O95057	198 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	ALPP	P05187	535 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PROS1	P07225	676 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	THBS1	P07996	1170 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CPM	P14384	443 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CDH3	P22223	829 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	PRKACG	P22612	351 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CBL	P22681	906 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	GGT2	P36268	569 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	MC3R	P41968	323 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	XK	P51811	444 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	NXPH1	P58417	271 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	COX10	Q12887	443 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	CDK5R2	Q13319	367 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	FZD5	Q13467	585 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	RAPSN	Q13702	412 aa		9.05	□□□□□ -0.96
UFD1-208	ENST00000484101	DGCR6	Q14129	220 aa		9.05	□□□□□ -0.96

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