RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF1-208	ENST00000472045	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	CTRC	Q99895	268 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PALMD	Q9NP74	551 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ABCB9	Q9NP78	766 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045		H0YC42	278 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045		J3QLW9	94 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	AIRE	O43918	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ETFA	P13804	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF19	P17023	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	MXD1	Q05195	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PIP5K1A	Q99755	562 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	FGF22	Q9HCT0	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	KDELR2	P33947	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SFTPD	P35247	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	EPHA4	P54764	986 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TSPAN5	P62079	268 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	GALK2	Q01415	458 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	QPRT	Q15274	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ARL9	Q6T311	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	C1orf21	Q9H246	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	RREB1	Q92766	1687 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045		H0Y8X5	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	AP1G1	O43747	822 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	B4GALT3	O60512	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	INMT	O95050	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	HCK	P08631	526 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PEPD	P12955	493 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TGFBR2	P37173	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PDLIM1	O00151	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ITGA5	P08648	1049 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	HTR1A	P08908	422 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045		G3V2L1	256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	AREL1	O15033	823 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SLC5A2	P31639	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	SLC6A8	P48029	635 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	RHD	Q02161	417 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IRF1-208	ENST00000472045		H3BML4	177 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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