RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PM20D1Q6GTS8 502 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 OLFM4Q6UX06 510 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP14Q86W24 1093 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA0895Q8NCT3 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR148Q8TDV2 347 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 RANBP9Q96S59 729 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 HSD17B14Q9BPX1 270 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 S100A14Q9HCY8 104 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 MED17Q9NVC6 651 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ARMCX1Q9P291 453 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NARFQ9UHQ1 456 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA2Q9UM82 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAH12Q6ZR08 3092 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 USP24Q9UPU5 2620 aa2.99□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CD163L1Q9NR16 1453 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ALPK3Q96L96 1907 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CTDSPLO15194 276 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ACKR3P25106 362 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 IER3P46695 156 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPY1Q01534 308 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR50Q13585 617 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 VSIG1Q86XK7 387 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NAXDQ8IW45 347 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 Q8N7P7 452 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 BEST4Q8NFU0 473 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 AFAP1L1Q8TED9 768 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 RFT1Q96AA3 541 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA17Q96L03 361 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR173Q9NS66 373 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CUTCQ9NTM9 273 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 TMED7Q9Y3B3 224 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 VPS8Q8N3P4 1428 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC37A2A6NM11 1700 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SCN7AQ01118 1682 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3TC1Q8TE82 1336 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 FANCIQ9NVI1 1328 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM168BA1KXE4 195 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 OOEPA6NGQ2 149 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC30A4O14863 429 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 HSPA4LO95757 839 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PROS1P07225 676 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GSTA2P09210 222 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SKILP12757 684 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 PRG2P13727 222 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF19P17023 458 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 BRCC3P46736 316 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ADARP55265 1226 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 LIPJQ5W064 366 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ARMCX5Q6P1M9 558 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 RFWD3Q6PCD5 774 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM64Q6YI46 380 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GLRX5Q86SX6 157 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 SERINC5Q86VE9 423 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CLEC1AQ8NC01 280 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 CUEDC2Q9H467 287 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GTF3C4Q9UKN8 822 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO7Q9Y3I1 522 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 FLT4P35916 1363 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 KDRP35968 1356 aa2.97□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 GAKO14976 1311 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-206ENST00000467748 OR5H15A6NDH6 313 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-206ENST00000467748 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF724A8MTY0 619 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-206ENST00000467748 CCSO14618 274 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms