RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF217O75362 1048 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PDE9AO76083 593 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MED26O95402 600 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LGI1O95970 557 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ATP1B1P05026 303 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CTSBP07858 339 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GUSBP08236 651 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR12D1P0DN82 309 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ANXA8P13928 327 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PVRP15151 417 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CD46P15529 392 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ITGA2P17301 1181 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ALOX12P18054 663 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CD27P26842 260 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NTSP30990 170 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PTGER1P34995 402 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KRT20P35900 424 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MC3RP41968 323 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LIMK1P53667 647 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BTN3A2P78410 334 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 EFNB1P98172 346 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PLAURQ03405 335 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RGS1Q08116 209 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TGM3Q08188 693 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP8Q13202 625 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DGCR6Q14129 220 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 IRF3Q14653 427 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LTB4RQ15722 352 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 INAVAQ3KP66 663 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BROXQ5VW32 411 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MED25Q71SY5 747 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MRGPREQ86SM8 312 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC103Q8IW40 242 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GJD3Q8N144 294 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CA13Q8N1Q1 262 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SMYD1Q8NB12 490 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MORN4Q8NDC4 146 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SETD9Q8NE22 299 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FLCNQ8NFG4 579 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TSTD1Q8NFU3 115 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR7G2Q8NG99 324 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BBS10Q8TAM1 723 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SPPL2AQ8TCT8 520 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF675Q8TD23 568 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FAR1Q8WVX9 515 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LZICQ8WZA0 190 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TANKQ92844 425 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2FQ969M7 185 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ISOC1Q96CN7 298 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGDIGQ99819 225 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RHNO1Q9BSD3 238 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FAM60AQ9NP50 221 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KRT84Q9NSB2 600 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms