RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 PAQR8Q8TEZ7 354 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PHF12Q96QT6 1004 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 HRH3Q9Y5N1 445 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF407Q9C0G0 2248 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC22BO75396 215 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP6AP2O75787 350 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TPOP07202 933 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00032P0C843 101 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TACR1P25103 407 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ARRB2P32121 409 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CD163Q86VB7 1156 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 EGLN2Q96KS0 407 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SIRT5Q9NXA8 310 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB21Q9UL25 225 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 NCKAP5O14513 1909 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RFPL3SP0C7P2 107 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PTGS2P35354 604 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNJ2P63252 427 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 HEPACAMQ14CZ8 416 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 NTRK2Q16620 822 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 KANK2Q63ZY3 851 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM71E1Q6IPT2 247 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 NOXRED1Q6NXP6 359 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 Q6ZSR9 355 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TP53INP1Q96A56 240 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CTHRC1Q96CG8 243 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CENPHQ9H3R5 247 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 EHD3Q9NZN3 535 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 GIMAP2Q9UG22 337 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ENTPD4Q9Y227 616 aa21.98■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 ACOT7O00154 380 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TYROBPO43914 113 aa21.97■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 DIO2Q92813 273 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 BBS4Q96RK4 519 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa21.97■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 PCNX1Q96RV3 2341 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR91A4D1P6 747 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC3CA6NJW4 275 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC28A1O00337 649 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAM10O14672 748 aa21.96■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0040Q15053 153 aa21.96■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 OR7G2Q8NG99 324 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.96■■□□□ 1.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM57AQ8TBR7 257 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ZIM3Q96PE6 472 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 MYNNQ9NPC7 610 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PLSCR2Q9NRY7 297 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAF6Q9Y4K3 522 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 NPIPA2E9PIF3 369 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 NPIPA3F8WFD2 350 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 PRRG2O14669 202 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 PIP5K1BO14986 540 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 RGS14O43566 566 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 AKAP10O43572 662 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 BPGMP07738 259 aa21.95■■□□□ 1.1
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