RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 INIPQ9NRY2 104 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KCNE3Q9Y6H6 103 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 AIFM1O95831 613 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SOX6P35712 828 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 AHRP35869 848 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SOX3P41225 446 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SEPHS1P49903 392 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SLC25A30Q5SVS4 291 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC190Q86UF4 302 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 OR2L5Q8NG80 312 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PRRC1Q96M27 445 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.08■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GIPRP48546 466 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PCYT1AP49585 367 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ABATP80404 500 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFA9Q16795 377 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 C18orf63Q68DL7 685 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 IQCHQ86VS3 1027 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00471Q8N535 108 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 RMI1Q9H9A7 625 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0G2JPF8 293 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 MED26O95402 600 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CRYBB2P43320 205 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ARFIP1P53367 373 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CDK5Q00535 292 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 KRT33BQ14525 404 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 BHLHB9Q6PI77 547 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 POC5Q8NA72 575 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ITFG2Q969R8 447 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 MND1Q9BWT6 205 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 A0A075B6Q4 140 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PRR23AA6NEV1 266 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CTDSP2O14595 271 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 APODP05090 189 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 FHP07954 510 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 F3P13726 295 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CERS1P27544 350 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 IGFALSP35858 605 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GINS1Q14691 196 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM107Q6UX40 140 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PINK1Q9BXM7 581 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 NUAK2Q9H093 628 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.07■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 KCNJ13O60928 360 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GUCY1B2O75343 617 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ATP6V1G1O75348 118 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SGCGQ13326 291 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GNA13Q14344 377 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CEBPEQ15744 281 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 RPE65Q16518 533 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SYT14P1Q58G82 188 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 HTRA1Q92743 480 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PQU0 124 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SNX4O95219 450 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SOX9P48436 509 aa15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SHQ1-202ENST00000444040 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms