RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 TNFRSF4P43489 277 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CLCN7P51798 805 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CDH12P55289 794 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SPIBQ01892 262 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 GPR155Q7Z3F1 870 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PDZD3Q86UT5 571 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RBFAQ8N0V3 343 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RIT1Q92963 219 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 HHIPQ96QV1 700 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RDH8Q9NYR8 311 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZAR1LA6NP61 321 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ISM1B1AKI9 464 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ENTPD6O75354 484 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 EGFP01133 1207 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 EBLN1P0CF75 366 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CTPS1P17812 591 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KIR3DL1P43629 444 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TTPAP49638 278 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF33BQ06732 778 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TDGQ13569 410 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF273Q14593 569 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 P2RY14Q15391 338 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ARSIQ5FYB1 569 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 STK40Q8N2I9 435 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 EID2BQ96D98 161 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KCTD7Q96MP8 289 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 IL36AQ9UHA7 158 aa15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TRBC1P01850 177 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SRFP11831 508 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TACR1P25103 407 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CNR2P34972 360 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 HSF2Q03933 536 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CDKN3Q16667 212 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 FAM46DQ8NEK8 389 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM163Q8TC26 289 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 NELL2Q99435 816 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 NTMT1Q9BV86 223 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ACPTQ9BZG2 426 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 LRATO95237 230 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 GUCA1CO95843 209 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 POU2F1P14859 743 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TPMTP51580 245 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 METAP1P53582 386 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SEC13P55735 322 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SELENOWP63302 87 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 IL18Q14116 193 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RNLSQ5VYX0 342 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RBP7Q96R05 134 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 IFT46Q9NQC8 304 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MALT1Q9UDY8 824 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF222Q9UK12 451 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF175Q9Y473 711 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TSPAN11A1L157 253 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 MPC2O95563 127 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 ANXA3P12429 323 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 GDF5P43026 501 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SNAPC1Q16533 368 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 LAS2Q8IYD9 372 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 GSX2Q9BZM3 304 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PRSS16Q9NQE7 514 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PCSK2P16519 638 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SDC1P18827 310 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 STOMP27105 288 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 HNF1BP35680 557 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 EVX1P49640 407 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 CRISP1P54107 249 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms